在二战后期，纳粹德国意识到战败已成定局，于是开始研究“非常规方案”，代号nova6的研究计划启动。由生化博士Dr.FriedrichSteiner带队的纳粹科学家成功研制出一种毁灭性的大规模杀伤性毒气。纳粹甚至已经计划好通过V2导弹和毒气对盟国发动袭击，准备先对华盛顿和莫斯科下手。幸运的是，在这千钧一发的时刻，运载毒气的货轮在北极圈附近被英军的轰炸机炸搁浅了，更倒霉的是德军还没来得及回收毒气，盟军已经攻陷了柏林，大当家（希特勒）自杀了，德国投降。
Dr.Steiner是个有野心的人，他不甘心就这么结束，暗中联系了苏军中的某军官Dragovish（本作头号BOSS）。于是，苏军计划了一次奥林匹斯行动。剧情跨越时间为1961年-1968年，另外有一关雷兹诺夫的回忆，控制雷兹诺夫与迪米特里并肩作战，时间是1945年（二战关卡）。
按时间线归纳如下：
- 1945年10月29日，突袭货轮残骸；
- 1961年4月17日，猪湾行动；
- 1963年10月6日，劳工暴乱；
- 1963年11月10日，刺杀计划；
- 1963年11月17日，闪电行动。
- 突袭货轮残骸
1945年10月29日，Dragovish和他的副官Kravchenko带领苏军第三突击集团军突袭货轮残骸。在这次行动中，原5代的苏军战役猪脚DimitriPetrenko和ViktorReznov也客串了一下。原5代中苏军最后一关，dimitri和raznov攻入柏林帝国议会大厦，dimitri在胜利的最后关头中了冷枪，坚持把苏联国旗插上帝国议会大厦楼顶。之后这两个老兄刚巧被分配到第三突击集团军参加了这次行动。
行动非常顺利，在Dragovish、Kravchenko、Dimitri、Reznov的带领下，苏军很快突入德军内部，找到了Dr.Steiner然后顺利拿到了毒气。这时，Dragovish想试试毒气威力，同时主要也是为了灭口，将Raznov和Dimitri的部队逮捕，之后就在那个货船中，Dimitri在密闭仓里被毒气毒死，死状非常惨，而Raznov在刚要被毒死的时候，英军特种部队刚好杀到，Dragovish和Steiner等人立刻溜了，而Raznov和几个幸存的弟兄在混乱中从英军和苏军中杀了出来，并成功将货轮炸沉，这样英军没有获得毒气，但是Dr.Steiner还活着，毒气并没有完全消失。之后Raznov不知什么原因被苏联抓获，关在了vorkuta劳改所。
- 猪湾行动
1961年4月17日，美国对古巴发动猪湾行动。历史上真有这次行动，但游戏中的剧情和历史完全不同。CIA特工Mason和队友woods、bowman奉命刺杀FidelCastro。行动非常顺利，三人顺利杀入古巴军内部，Mason亲手杀死Castro，woods还上前补了好几枪，之后三人顺利登上逃亡的飞机，但是在飞机在跑道上启动时，Mason看到敌人有大量装甲车和防空炮赶来，毅然跳下飞机利用路边的一座防空炮消灭敌人大量装甲车，之后队友的飞机顺利起飞并逃走，而Mason被古巴GCD抓走。
之后Mason醒来，发现自己在某海边，旁边有一艘写有RUSALRA的大货轮（这实际上就是Dragovish发布广播的秘密通讯基地），而Castro竟活生生站在自己面前，另外还有Dragovish和Kravchenko！通过他们的谈话得知Castro早已知道CIA的刺杀计划，Mason他们杀死的那人只不过是个替身，之后Castro将Mason当做“礼物”交给Dragovish，并请Dragovish折磨Mason。之后Dragovish和Dr.Steiner似乎有另一个秘密研究，他们将某些犯人进行洗脑，让其为自己服务。由于Mason本就是CIA特工，很适合拿来作杀人工具，他们对Mason实施了洗脑，灌输了刺杀美国总统肯尼迪的命令！同时还在Mason大脑里植入了一套密码破译程序！但是Mason不是普通人，他有超强的意志，对他的洗脑失败了，于是Dr.Steiner放弃了Mason，将他发配到vorkuta劳改所。
- 劳工暴乱
1963年10月6日，Raznov领导其他劳工发动了计划好的暴乱，混乱中大量劳工被杀，Mason和Raznov并肩作战，最后成功杀了出来，最后Raznov成功送Mason跳上路过的一列货运火车，而他自己为了让Mason能成功脱身而驾驶卡车朝另一个方向开去以吸引追兵的注意。之后Mason成功逃出，而在后来Hudson的分析中得知Raznov自己没成功，在这次逃亡中被杀死了。之后剧情中Raznov经常会在关键时刻出现帮助Mason，那实际上都是Mason的幻觉。
- 刺杀计划
一个月后，1963年11月10日，Mason回到了五角大楼，在通过忠诚测试后，又重新成为CIA特工，JasonHudson成为了他新的handler。肯尼迪总统亲自召见了Mason，给了他一个刺杀Dragovish的任务，Mason当然接受了任务。
- 闪电行动
一周后，1963年11月17日，CIA实施了闪电行动，几名特种部队战士（Woods、Mason、Bowman、Weaver、Brooks）袭击了苏联的baikonur太空基地，任务包括：破坏苏联的远程导弹（火箭），消灭苏联激进分子（包括Dragovish）以及一些投降苏联的纳粹科学家，Weaver在这次行动中被弄瞎了一只眼，最后众人杀到火箭控制台却发现控制台坏了，无法停止发射远程导弹（火箭）。但是苏联的科学家想的太周到了，他们早已考虑到万一有员工不小心发射了火箭而控制台刚好失灵无法终止的情况，于是事先在控制台门口存放了一支火箭发射器用来把火箭打下来，之后Mason执意要找到Dragovish并亲手杀死他（被洗脑的后果），但是Dragovish早已逃走。
这款游戏以其紧张刺激的剧情和逼真的游戏体验，赢得了众多玩家的喜爱。希望以上解析能让您对《使命召唤7黑色行动》有更深入的了解。
